对基因组dna dna相互作用是重要的压实和转录监管。在如此复杂的研究过程中,DNA通常被建模为一个均匀带电圆柱体和它的静电相互作用计算框架内的Poisson-Boltzmann方程。通常,适应因素是用于解决这种理论方法的局限性。尽管相当大的理论和实验工作,缺乏严格的定量评估这个参数。这里,我们综合特征DNA DNA相互作用的单价离子通过分析单个DNA分子的行为成为超螺旋恒张力下举行。这个过程的理论模型和粗粒度的模拟显示惊人的小DNA的有效40 \ %的名义上的电荷密度,另外支持的所有原子分子动力学模拟。