在过去的几十年中,分子动力学(MD)模拟生物分子已成为主流生物物理技术。的长度和时间尺度适合医学方法增加,经验力场的缺点,已开发和验证使用相对较短的小分子的模拟变得明显。一个常见的工件是聚合的水溶性生物分子由人为强烈{\ textendash}电荷的相互作用。在这里,我们报告一个系统化的原子pair-specific细化Lennard-Jones参数(NBFIX)描述胺{\ textendash}羧酸盐和磷酸胺{\ textendash}交互,使MD模拟基本peptide-mediated核酸总成和脂质双分子层膜更好的协议与实验数据。作为我们细化不影响现有的保税交互参数化或改变溶剂化自由能,它提高了现实主义的MD模拟不引入额外的工件。