最近的计算技术的进步使蛮力分子动力学(MD)模拟蛋白质折叠使用基于物理分子力场。提供的广泛的抽样的蛋白质构象模拟显示,然而,相当大的压实蛋白质构象的展开状态,这是不符合实验。在这里,我们表明,一组手术修正nonbonded胺氮{\ textendash}羧酸盐氧之间的相互作用和脂族碳{\ textendash}可以大大提高碳原子对蛋白质折叠模拟的现实主义。具体来说,我们表明,采用修正500年\ ~{}μs所有原子replica-exchange WW的MD模拟域和villin头片蛋白质变性蛋白质的大小增加{\ textquoteright}构象,不破坏蛋白质的天然构象。除了使各自的折叠构象全球最小自由能景观在室温下,我们的修正也使自由能景观顺畅,大大加速了折叠动力学和,因此,减少蛋白质折叠模拟的计算费用。