使用纳米孔单分子测序的蛋白质——类似于纳米孔测序DNA——面临多重挑战,包括复杂的蛋白质三级结构的展开和实施他们的单向通过纳米孔易位。这里,我们结合分子动力学(MD)模拟单分子实验探讨SDS(十二烷基硫酸钠)的效用为固态纳米孔易位展开的蛋白质,同时赋予他们更强的电荷。我们的模拟和实验证明SDS-treated蛋白质表现出相当大的损失的蛋白质结构在纳米孔易位。此外,SDS-treated蛋白质通过纳米孔的方向把规定的由SDS电泳力由于负电荷受损。总之,我们的研究结果表明,蛋白质SDS原因展开而促进蛋白质在电泳力的方向移位;这两个特点是有利的为未来的蛋白质使用固态纳米孔测序应用程序。