对接的蛋白质- DNA复杂到纳米孔可以提供充足的观察时间,并使生物纳米孔的分析应用程序的集合,包括DNA测序。然而,同样的原则的应用固态纳米孔受到贫穷对对接过程的理解。这里,我们阐明的行为个体蛋白质- DNA复合物停靠在固态纳米孔通过监测纳米孔离子电流。发现重复对接单价链霉亲和素- DNA复合物产生离子电流封锁之间波动离散的水平。我们阐明蛋白质插头和DNA的角色范围在对接过程中,找到对接配置来确定当前的许多封锁的水平,而目前的频率切换是由分子间的相互作用和固态膜。最后,我们证明使用纳米孔对接的可行性原则使用固态纳米孔单分子检测通过检测拴在DNA分子的构象变化的随机线圈i-motif状态。