在短短十年的开创性工作证明纳米孔的效用分子传感、纳米孔单分子已成为通用的系统操作和分析。在一个典型的设置中,静电势的梯度捕捉带电溶质从溶液并迫使他们将通过一个单一的纳米孔,在原本不透水膜。产生的离子电流封锁的溶质在纳米孔可以揭示溶质的类型,例如,一个DNA链的核苷酸组成。尽管巨大的成功,这种随机的微观机制功能传感器在很大程度上仍未知,因为它不是目前可能直接描述单个生物分子的微观构象在纳米孔,从而明确建立可见之间的因果关系和微观的事件。这种关系可以确定使用分子动态计算方法,该方法可以准确地预测分子的时间演化系统从一个给定的微观状态。本文描述了近年来的应用此方法的过程中DNA运输通过生物和合成纳米孔。