@article{63,标题={结构改进的探讨adhesin使用分子动力学},杂志= {Biophys J},体积={93}={2007},月={2007年11月1日},页面={3058 - 69},文摘= {

探讨从脑膜炎奈瑟菌、脑膜炎球菌性脑膜炎和败血症的病原体,是不可或缺的外膜蛋白,促进了脑膜炎球菌粘附易感细胞的蛋白多糖受体通过绑定。两种结构的探讨已经由2 x射线衍射分辨率,揭示细胞外循环中截然不同的构象,蛋白质域与蛋白聚糖绑定。在第一个结构,一个带正电的裂隙形成的循环1和2被确认为网站绑定蛋白聚糖,而在第二个结构缝隙不明显循环1和2采用不同的构象。调和这些结果,进行了分子动力学模拟在两个结构嵌入在溶剂化脂质双分子层膜。自由水晶接触和结晶剂,观察循环进行大型结构转换,表明环的构象在x射线结晶结构的影响。后续模拟这两种结构的晶体晶格证实了这一结论。基于分子动力学轨迹,我们提出一个模型的探讨,结合稳定可用的x射线结构的结构特点。在这个模型中,所有5个细胞外循环的探讨有稳定的二级结构。导致的循环形成一个漏斗的底部beta-barrel包括酪氨酸暴露面- 169,已与蛋白聚糖绑定。

},关键词={丰富,细菌、细菌外膜蛋白,计算机模拟、晶体学、x射线、模型、分子、脑膜炎奈瑟菌,蛋白质结构,三级,热力学},issn ={0006 - 3495},作者doi = {10.1529 / biophysj.107.106724} ={烹调的菜肴,Binquan凯弗雷,马丁和阿列克谢Aksimentiev}}