% 0期刊文章% J J phy提供者物质以DNA % % D 2014% T接触克里斯托弗Maffeo %柳,J % %杰弗里·卡莫井,D B %的菜肴,B %阿列克谢Aksimentiev % K审查% X

在过去的十年里,所有原子分子动力学方法生长在两个系统的规模和过程服从它的能力和对实验系统的行为做出定量预测。DNA计算研究领域也不例外,见证一个戏剧性的增加系统模拟原子分辨率的大小,期间个人模拟和仿真结果的现实主义。在这个局部评审中,我们描述DNA的物理属性标志从所有原子的角度模拟。我们展示的神奇的能力这种模拟,揭示了微观物理实验观察现象的起源。我们也讨论存在的令人沮丧的局限与缺陷相关的原子力场和采样不足。审查主要集中在以下四个物理特性的DNA:有效的电荷,应对外部机械力,与其他DNA分子相互作用和行为在外部电场。

26% % B J phy提供者物质% V P 413101% 8 10/2014 % G eng % N R 0953 - 8984/26/41/413101 10.1088 / 41%