% 0期刊文章% % D J生物物理2014% T DNA顺利运输通过缩小孔隙几何形状%卡森斯宾塞%一个James Wilson %阿列克谢Aksimentiev % Meni Wanunu % X

Voltage-driven运输双链DNA通过纳米孔持有多少定量分子生物学和生物技术的应用潜力,然而易位的微观细节已被证明是具有挑战性的破译。早期的实验显示强烈的依赖交通动力学孔径:快速常规交通大毛孔(> 5 nm直径),和慢但异构运输时间分布在sub-5纳米孔,这意味着大型位置不确定性的DNA孔隙作为易位时间的函数。在这项工作中,我们表明,该异常交通是DNA self-interaction的结果,这一现象是严格孔径依赖。我们确定一个政权的DNA交通规则,生产窄和彬彬有礼的停留时间分布符合一个简单drift-diffusion理论。此外,系统研究停留时间依赖的DNA长度显示一个幂律缩放1.37在35 - 20000个基点。我们强调我们的纳米孔设备的分辨率识别通过单脉冲100和500个基点碎片混合物中,准确率> 98%。当耦合到一个适当的顺序标记方法,观察DNA易位可以顺利为高分辨率铺平道路DNA映射和上浆应用基因组学。

% B生物物理杂志% V P 2381 - 2393% 107% 10.1016 G eng http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349514010686 % % U R / j.bpj.2014.10.017