% 0期刊文章% % D J核酸研究2017% T DNA分子机制与单链DNA结合蛋白% Maffeo,阿列克谢Aksimentiev克里斯托弗•% % X

在DNA复制过程中,单链DNA单链DNA结合蛋白质(单边带)包装(ssDNA)与高亲和力防止退化和防止二级结构的形成。虽然单边带ssDNA紧密结合,它可以重新定位以及ssDNA复制叉的进步。使用所有原子分子动力学模拟,我们为特征的分子机制和单边带ssDNA协会。放置在溶液中,ssDNA-SSB总成观察自发地改变他们的结构;这些结构性变化抑制晶体的环境。重复模拟SSB-ssDNA复杂的机械张力显示多种可能的途径ssDNA脱落单边带被长期逮捕单边带表面可再生的地点。合奏的模拟自然协会短ssDNA碎片单边带详细的三维地图的地方亲和力DNA;均衡数量的ssDNA绑定到单边带被发现取决于电解液浓度而不是单边带酸性的存在提示的尾巴。自发形成ssDNA沿着单边带表面凸起及其扩散运动直接观察在多个10-µs-long模拟。这种reptation-like运动是在通过DNA结合的高亲和性,暗示两步单边带扩散的机制。

% % V B核酸研究45% 12125 - 12139 P % 8 12/2017 % G eng % U http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx917 % N R / nar / gkx917 10.1093 21%和12125%