DNA折纸是一个很好的工具来构建复杂的人工纳米结构。这些结构的功能化提供了精确的组织的物质在纳米尺度上的可能性。在实践中,努力奋进号可以通过静电斥力阻碍或其他在分子尺度上的动态,导致不服从当地的结构。使用单分子担心显微镜结合粗粒度的布朗动力学模拟,我们调查了周围的局部结构DNA折纸盒子的盖子,可以通过特定DNA键打开。我们发现担心信号的封闭盒子取决于缓冲离子浓度和小改变DNA结构设计。全球和本地的模拟提供了一个视图的结构和显示框之间的距离墙壁和盖发生波动。这些结果为vizualise提供方法,提高三维DNA折纸的局部结构组件,并提供指导锻炼控制化学组和配体的位置。