我们提出一种技术来确定单个荧光团的取向与DNA折纸结构基于两个测量。首先,吸收分子的跃迁偶极子的方向决定通过polarization-resolved激励测量。第二,DNA折纸结构的方向从DNA-PAINT获得nanoscopy测量。两种荧光大视场显微镜测量连续执行。我们使用这种方法来研究取向的单身阿647 n, 643年阿,和Cy5荧光体共价连接到一个2 d矩形nanoenvironments DNA折纸结构不同,通过改变两种荧光团的绑定位置和附近。我们的研究结果表明,当荧光团与额外的空间整合,例如,通过省略核苷酸在另外的双股的环境,他们会坚持DNA,采用择优取向,更取决于特定的分子环境比荧光团的类型。借助所有原子分子动力学模拟,我们观察和合理化提供洞察荧光团的可能绑定模式。我们认为这项工作是一个重要的一步操作的方向单一荧光体DNA折纸结构,这是至关重要的发展更有效的和可再生的自组装纳米光子设备。