分析物的检测和使用生物纳米孔测序DNA近年来取得了重大的进步。蛋白质和多肽纳米孔的分析,然而,复杂的物理化学结构很复杂的多肽和捕获机制的缺乏理解和认可的多肽纳米孔。在这项工作中,我们表明,引入腔内的确切位置的芳香族氨基酸α-helical fragaceatoxin C(压裂)纳米孔肽的捕获频率增加,很大程度上提高多肽类似的大小之间的歧视。分子动力学模拟确定了纳米孔的感应区域,阐明微观机制使肽的准确描述通过离子电流封锁在压裂和毛孔的效果修改特征肽歧视。这项工作提供了建议,以提高识别和捕获的增强肽通过纳米孔,这是很重要的对于发展中一个实时和单分子大小分析仪肽识别和鉴定。