% 0期刊文章% J Biophys % D 2004% T DNA通过合成纳米孔易位%的微观动力学阿列克谢Aksimentiev % Gregory Timp Jiunn B亨% %克劳斯舒尔腾% K生物运输% K生物物理学% K DNA % K电泳% K电生理学% K溶血素蛋白% K离子% K动力学% K金属% K模型,分子% K模型,统计% K纳米技术% K核酸构象% K氧化物% K半导体% K压力、机械% % X K时间因素

我们之前已经证明纳米厚的纳米直径孔metal-oxide-semiconductor-compatible膜可以用作传感器检测DNA分子。使用这种类型的设备的前景测序DNA被热切的追求。传感器是电子磁场诱导的关键属性(voltage-driven)易位DNA分子的跨膜电解溶液通过纳米孔。补充的实验研究发展这样的毛孔和测量信号以响应DNA的存在,我们进行了分子动力学模拟的DNA通过纳米孔易位。典型的模拟系统包括一个补丁的氮化硅膜的氯化钾水溶液划分成两个隔间纳米孔连接。外部电场诱导的DNA分子捕获的孔隙溶液和随后的易位。分子动力学模拟表明20-basepair双链DNA片段可以运输2.2 x 2.6纳米的纳米孔(2)截面在典型电场在几微秒。DNA碱基之间的疏水相互作用和孔隙表面可以减缓单链DNA和易位可能测定孔隙内的双链DNA。DNA阻塞毛孔口块电解电流通过孔隙;这些电流封锁有相同的级封锁观察DNA凌日时孔隙。 The feasibility of using molecular dynamics simulations to relate the level of the blocked ionic current to the sequence of DNA was investigated.

% B Biophys J % V 2086 - 97 P % 87% 8 2004年9月% G eng % N R 10.1529 / biophysj.104.042960 3%