Yann Robert Chemla
初级研究领域
- 生物物理学
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教育
- 加利福尼亚大学 - 伯克利分校物理学博士,2001年
传
Yann Chemla教授获得了博士学位。他于2001年获得了加利福尼亚大学伯克利分校的物理学博士学位。受过凝结的实验家培训,他通过研究磁性细菌以及对基于磁性纳米粒子的生物传感器的发展对生物物理学产生了兴趣。Chemla教授完成了他在伯克利(Berkeley)Carlos Bustamante教授实验室的博士后研究员的过渡。在那里,他使用光学镊子研究病毒中的DNA包装进行了训练。他于2007年加入了伊利诺伊大学伊利诺伊大学的物理系。他是NSF职业奖和斯隆基金会研究奖学金的获得者,并被任命为美国物理学会的研究员。自2015年以来,他一直担任NSF物理边界中心(PFC)的联合导演“活细胞物理中心”(CPLC)。
研究声明
活细胞是复杂分子结构的非凡“工厂”,它们执行专门的机械任务,并像纳米级机器一样起作用。这些分子机器参与了广泛的生物学过程,从忠实地复制基因组到促进细胞。从广义上讲,Chemla组有兴趣了解这些机器运行,与其他细胞分子相互作用并受到调节的机制。聚焦的一个区域是处理和维持基因组DNA的蛋白质。
我们的实验室使用强大的生物物理技术一次遵循这些过程,一次避免了传统合奏方法的平均伪像。光学陷阱或“光学镊子”(使用聚焦激光产生的力来操纵微观物体,允许我们实时遵循单个分子的轨迹并测量其产生的力。
Chemla实验室中的研究涉及开发新的方法论,并通过这些进步来实现科学发现。示例包括高分辨率光镊的发展Ångström规模运动DNA上的蛋白质和光学陷阱荧光显微镜的合并构象动力学在DNA加工机中。我们的小组进一步扩展了这些方法来研究融合亚细胞蛋白冷凝物的货运运输在牢房内,动力学单个游泳细菌细胞。
Chemla实验室在该领域所有研究方面的工作:最先进的仪器的设计和构建,使用单分子操纵方法对生物系统进行研究,以及对收集轨迹的定量分析和建模。感兴趣的学生和博士后,具有物理,生物学,化学或相关领域的背景联络我。
期刊选定的文章
- Carney SP,MA W,Whitley KD,Jia H,Lohman TM,Luthey-Schulten Z,Chemla Yr。(2021)“非尚型解旋酶解开DNA的动力学和结构机制”。纳特社区。12(1):7015。doi:10.1038/s41467-021-27304-6。
- Dai L,Singh D,Lu S,Kottadiel VI,Vafabakhsh R,Mahalingam M,Chemla YR,Ha T,Rao VB。(2021)“病毒基因组包装环ATPase是一种灵活的配位五角星。”纳特社区。12(1):6548。doi:10.1038/s41467-021-26800-Z。
- Stekas B,Yeo S,Troitskaia A,Honda M,Sho S,Spies M,Chemla Yr。(2021)“单链DNA结合蛋白对解旋酶加工性的开关状态。”Elife 10:E60515。
- Rhine K,Makurath MA,Liu J,Skanchy S,Lopez C,Catalan KF,Ma Y,Fare CM,Shorter J,Ha T,Chemla YR,Myong S.(2020)(2020年),“ ALS/FTLD连接突变中的FUS甘氨酸残留物中的突变导致加速凝胶化并减少与野生型FUS的相互作用。”摩尔细胞。80(4):666-681.e8。
- Mitra J,Makurath MA,NGO TTM,Troitskaia A,Chemla YR,Ha T.(2019)“人类端粒DNA的极端机械多样性显示出荧光力光谱的揭示。”Proc Natl Acad Sci U S A. 116(17):8350-8359
- Makurath MA,Whitley KD,Nguyen B,Lohman TM,Chemla Yr。(2019年)“由自动抑制子域对REP解旋酶的调节。”核酸res。47(5):2523-2532。
- Whitley K.D.,Comstock M.J.,Chemla Y.R.(2018)“超短核酸双链体具有长长的蠕虫样链行为,具有力依赖性边缘效应”。莱特牧师。120,068102
- Whitley K.D.,Comstock M.J.,Chemla Y.R.(2017)“寡核苷酸杂交过渡状态的弹性”。核酸res。45(2):547-555。
- Suksombat S.,Khafizov R.,Kozlov A.G.,Lohman T.M.,Chemla Y.R.(2015)“大肠杆菌单链DNA结合蛋白的结构动力学揭示了DNA包裹和拆开途径。”Elife,4:E08193
- Comstock M.J.,Whitley K.D.,Jia H.,Sokoloski J.,Lohman T.M.,Ha T.,Chemla Y.R.(2015)“核酸加工酶中结构功能关系的直接观察”科学348(6232):352-354
- Arslan S.,Khafizov R.,Thomas C.D.,Chemla Y.R.,Ha T.(2015)“通过构象控制对超螺旋酶的工程”科学348(6232):344-347
- Mears,P.J.,Koirala,S.,Rao,C.V.,Golding,I.,Chemla,Y.R。(2014年)“大肠杆菌游泳对鞭毛编号的变化非常强大” Elife,3:e01916
- Qi,Z.,Pugh,R。,间谍。M.,Chemla,Y.R。(2013)“ XPD解旋酶放松的序列依赖碱基对垫脚动力学”,Elife,2:e00334
- Kottadiel,V.I.,Rao,V.B.,Chemla,Y.R。(2012年)“动态暂停无背包状态,噬菌体T4的DNA包装电机的转换恢复状态”,PNAS 109(49):20000-5
- Min,T.L.,Mears,P.J。,Golding,I。和Chemla,Y.R。(2012)“单个大肠杆菌细胞的趋化适应动力学”,PNAS,109(25):9869-74
- Comstock,M.J.,Ha,T.,Chemla,Y.R。(2011年)“具有单氟化合物灵敏度的超高分辨率光学陷阱”自然方法。8(4):335-40
- Min,T.L。Mears,P.J.,Chubiz,L.M.,Rao,C.V.,Golding,I.,Chemla,Y.R。6(11):831-835
荣誉
- 美国体育学会研究员(2020)
- 伊利诺伊大学,伊利诺伊大学,乌尔巴纳·坎佩恩大学(2016)的迪恩研究卓越研究奖
- 伊利诺伊大学威利特大学教师学者奖(2015年)
- 高级研究中心(2012年)
- 斯隆研究奖学金(2010)
- NSF职业奖(2009年)
- 科学界面(CASI)的职业奖项,Burroughs-Wellcome基金(2005)
最近的课程教了
- 物理102-大学物理:E&M&Modern
- 物理110-物理职业
- 物理211-大学物理学:力学
- 物理427-热和统计物理
学期将学生排名出色的老师
学期 | 课程 | 杰出的 |
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2020年春 | 物理102 | |
2018年秋季 | 物理211 | |
2017年春季 | 物理427 | |
2016年秋季 | 物理427 | |
2012年春季 | 物理427 |