下载最新版本的ARBD

补充实验研究，计算方法产生了太小且快速无法实验解决生物学和纳米技术系统实验的过程的分子图。最广泛使用的生物模拟方法All-Atom MD描述了具有原子分辨率的分子。但是，MD在计算上很昂贵，对于许多任务而言可能过于杀伤。粗粒（CG）布朗动力学（BD）模拟是对大分子复合物进行建模的有希望的替代方法。

BD通过通过点状粒子对溶质建模具有参数化的特性，但隐式处理溶剂分子，从而实现了计算经济。因此，CG BD仿真可用于克服全原子MD模拟的约束，这些模拟通常受到计算资源的限制，以在约10微秒和30纳米的情况下到达时间和长度尺度。

原子分辨率布朗动力学（ARBD）是一种利用GPU来促进快速模拟的代码。ARBD独特地支持包含具有位置和方向的网格指定物理颗粒的模型。

您可以下载arbd，使用CUDA工具包的最新版本编译，并开始测试包括示例。请与Chris Maffeo联系cmaffeo2@illinois.edu如果您使用该软件有任何麻烦。另外，请注意，该软件目前作为Alpha版本提供。