克里斯托弗Maffeo
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261年LLP)
Loomis物理实验室
西格林街1110号
乌尔班纳,61801 - 3080
有趣的生物功能的详细结构和动力学的分子。我用分子动力学模拟蒸馏定量micro-biological信息从dna蛋白质系统的所有原子模型的轨迹。通常我使用各种平衡和非平衡enhanced-sampling技术,包括伞抽样和引导分子动力学。一旦有效的交互被以这种方式提取的,它们可以用来探索生物分子动力学所有原子模拟时间尺度难以接近。我的工作都集中在DNA DNA和DNA蛋白质的相互作用,强调DNA的物理性质的重要性在决定其行为。请看到我的简历为更多的信息关于我的技能、经验和我的工作的结果。
出版物
- DNA复制和修复机械的分子机制:从微观模拟的见解”。先进的理论和模拟2:1800191 (2019)。 ”
- 合成DNA酶由翻转每秒10⁷脂质在生物膜”。自然通讯9:2426 (2018)。 dna-scramblase-si.pdf(5.77 MB) ”
- 光学电压传感使用DNA折纸”。纳米快报18:1962 - 1971 (2018)。 nl7b05354_si_001.pdf(2.72 MB) ”
- DNA分子机制与单链DNA结合蛋白”。核酸的研究45:12125 - 12139 (2017)。 ”
- 新创重建的DNA折纸结构通过原子的分子动力学模拟”。核酸的研究44:3013 - 3019 (2016)。 ”
- 近距离接触与DNA”。J phy提供者物质26:413101 (2014)。 ”
- 粗粒度模型的非结构化的单链DNA来自原子论的模拟和单分子实验”。理论和计算化学杂志》上10:2891 - 2896 (2014)。 伸展运动和控制局部加热的固态纳米孔的单链DNA”。ACS Nano7:6816-24 (2013)。 离子通道的建模与仿真”。化学牧师112:6250 - 6284 (2012)。 ” ” ”
- 优化DNA的分子动力学方法模拟和离子运输通过生物纳米孔”。方法杂志870:165 - 86 (2012)。 ”
- 端到端双螺旋DNA的吸引力”。核酸Res40:3812-21 (2012)。 在严格的超螺旋dna dna相互作用被一个小有效电荷密度”。物理评论列托人105:158101 (2010)。 ” ”
- 蛋白的结构、动力学和离子电导受五聚物”。Biophys J96:4853 - 65 (2009)。 ”