克里斯托弗Maffeo

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Loomis物理实验室
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有趣的生物功能的详细结构和动力学的分子。我用分子动力学模拟蒸馏定量micro-biological信息从dna蛋白质系统的所有原子模型的轨迹。通常我使用各种平衡和非平衡enhanced-sampling技术,包括伞抽样和引导分子动力学。一旦有效的交互被以这种方式提取的,它们可以用来探索生物分子动力学所有原子模拟时间尺度难以接近。我的工作都集中在DNA DNA和DNA蛋白质的相互作用,强调DNA的物理性质的重要性在决定其行为。请看到我的简历为更多的信息关于我的技能、经验和我的工作的结果。

出版物

  1. 克里斯托弗•Maffeo Han-Yi周,阿列克谢Aksimentiev。DNA复制和修复机械的分子机制:从微观模拟的见解”。先进的理论和模拟2:1800191 (2019)。
  2. 亚历山大•Ohmann陈钰,克里斯托弗•Maffeo Kareem Al -纳哈斯,凯文·n·鲍曼Kerstin Gopfrich Jejoong柳,乌尔里希·大尺度和阿列克谢Aksimentiev。合成DNA酶由翻转每秒10⁷脂质在生物膜”。自然通讯9:2426 (2018)。 PDF图标”title=dna-scramblase-si.pdf(5.77 MB)
  3. Elisa Alina Hemmig,克莱尔·菲茨杰拉德克里斯托弗•Maffeo丽莎检验员,莎拉•伊丽莎白Ochmann阿列克谢Aksimentiev、菲利普•Tinnefeld和乌尔里希大。光学电压传感使用DNA折纸”。纳米快报18:1962 - 1971 (2018)。 PDF图标”title=nl7b05354_si_001.pdf(2.72 MB)
  4. 克里斯托弗Maffeo,阿列克谢Aksimentiev。DNA分子机制与单链DNA结合蛋白”。核酸的研究45:12125 - 12139 (2017)。
  5. 克里斯托弗•Maffeo Jejoong Yoo和阿列克谢Aksimentiev。新创重建的DNA折纸结构通过原子的分子动力学模拟”。核酸的研究44:3013 - 3019 (2016)。
  6. 克里斯托弗•Maffeo J柳,杰弗里·卡莫D B井,B的菜肴,阿列克谢Aksimentiev。近距离接触与DNA”。J phy提供者物质26:413101 (2014)。
  7. 克里斯托弗•Maffeo Thuy t . m .非政府组织Taekjip公顷,阿列克谢Aksimentiev。粗粒度模型的非结构化的单链DNA来自原子论的模拟和单分子实验”。理论和计算化学杂志》上10:2891 - 2896 (2014)。 PDF图标”title=马克西姆Belkin克里斯托弗•Maffeo David b .井,阿列克谢Aksimentiev。伸展运动和控制局部加热的固态纳米孔的单链DNA”。ACS Nano7:6816-24 (2013)。 PDF图标”title=克里斯托弗•Maffeo斯瓦特Bhattacharya Jejoong柳,David b .井,阿列克谢Aksimentiev。离子通道的建模与仿真”。化学牧师112:6250 - 6284 (2012)。
  8. David b .井,他们育有Bhattacharya罗根卡尔,克里斯托弗•Maffeo安东尼·h·Ho杰弗里·卡莫和阿列克谢Aksimentiev。优化DNA的分子动力学方法模拟和离子运输通过生物纳米孔”。方法杂志870:165 - 86 (2012)。
  9. 克里斯托弗•Maffeo Binquan烹调的菜肴,阿列克谢Aksimentiev。端到端双螺旋DNA的吸引力”。核酸Res40:3812-21 (2012)。 PDF图标”title=克里斯托弗•Maffeo罗伯特•Schopflin Hergen Brutzer, Rene Stehr,阿列克谢Aksimentiev Gero Wedemann,拉尔夫·塞德尔。在严格的超螺旋dna dna相互作用被一个小有效电荷密度”。物理评论列托人105:158101 (2010)。
  10. 克里斯托弗Maffeo,阿列克谢Aksimentiev。蛋白的结构、动力学和离子电导受五聚物”。Biophys J96:4853 - 65 (2009)。