第三代纳米孔的DNA测序

Gregory Timp Utkur Mirsaidov,温斯顿Timp Jiwook垫片,Deqiang Wang Valentin季米特洛夫Jan Scrimgeour Chunchen林,杰弗里·卡莫安东尼·h·Ho Xueqing邹,阿列克谢Aksimentiev,克劳斯·斯考尔滕提出
纳米孔:传感基本生物单分子层面的交互287 - 311 (2011)
DOI:10.1007 / 978 - 1 - 4419 - 8252 - 0 - _12助理

随着新一代的基因测速(上天)技术,可以生成一个巨大的DNA测序数据量较低的成本,将日常医学基因组科学的把握。然而,陷入这大量的数据,一个新的问题出现了:基因组的组装短的读取。在这一章里,我们检查使用合成纳米孔测序DNA的前景。纳米孔测序有可能很长的读取,减少计算负担造成的校准和基因组组装,同时消除在逻辑上具有挑战性的和容易出错的放大和图书馆形成由于其精美的单分子敏感性。另一方面,长时间的高保真读取需求严格控制DNA配置在孔隙和易位动力学。我们检查满足这些规范的前景与合成纳米孔。