原位DNA分子力学砖:结构、力学性能和离子导电性

斯科特•迈克尔•斯隆陈钰,Jejoong柳,阿列克谢Aksimentiev
新物理学杂志18 055012 (2016)
DOI:10.1088 / 1367 - 2630/18/5/055012助理

短的DNA片段的DNA砖方法利用自组装生产定制的三维物体与subnanometer精度。与DNA折纸,DNA砖方法允许各种不同的结构来实现图书馆使用相同的DNA链。然而,由于他们的设计组装DNA砖结构较少interhelical连接相比,相当于DNA折纸结构。虽然DNA砖对象的整体形状特征,发现符合目标的功能设计,DNA砖对象的微观性质仍有待确定。在这里,我们使用所有原子分子动力学方法直接比较的结构、力学性能和离子电导率的DNA砖和DNA折纸结构不同的只有consistituent DNA链的内部连接。等效DNA折纸结构相比,DNA发现砖结构刚性和密集的和有更大的横截面区域正常DNA螺旋方向。在微观层面,DNA的结砖结构发现右撇子,类似于个人霍利迪的结构连接(HJ)解决方案,这与左撇子HJ DNA折纸的结构。受到外部电场,DNA砖板更漏离子比同等DNA折纸板由于其较低的密度和较大的截面面积。总的来说,我们的结果表明,该结构产生的DNA砖方法是相当类似的整体外观由DNA折纸方法但更符合受外力时,这可能是他们的单跨界设计的结果。

视频摘要的结果,介绍DNA自组装和简短的描述DNA折纸和DNA砖的设计规则。结构和机械的视频覆盖我们的结果差异,以及离子电导率的差异。