截断的选择性渗透水通道蛋白1在硅片

卡尔·德克尔,马丁页面,阿什利·博伊德,艾琳•麦卡利斯特马克·金斯堡和阿列克谢Aksimentiev
ACS生物材料科学与工程3 (3)342 - 348 (2017)
DOI:10.1021 / acsbiomaterials.6b00583助理

水通道蛋白(AQP)蛋白质功能高效水传输通道,支持在许多类型的活细胞内稳态。它们的结构关系特点是在基础和应用研究,主要通过结构分析、突变研究,和计算方法。本研究评估的影响进步截断的渗透性和离子电导率AQP-1(牛)。截断的使用来确定关键特性尚未考虑之前,作为物理截断AQP可能不是技术上可行的华丽的安排六个交织在单个孔隙结构α螺旋。然而,结构没有获得通过蛋白质组装可实现通过化学合成的方法和研究使用分子动力学(MD)模拟。这里,我们应用医学方法描述的渗透性AQP变体截断沿着孔轴从细胞质和细胞外的通道。仿真结果表明,AQP-1可以保留其功能即使删除多达50%的通道的长度,代表50%的蛋白质分子质量。删除这样的未来预计将大大简化生物仿生复制AQP功能使用合成大分子的努力。此研究表明,潜在的硅片方法支持创建精简功能类似物的生物分子机器。