通过纳米通道建模的驱使运输的蛋白质

罗根卡尔,马克·d·金斯堡,阿列克谢Aksimentiev杰弗里·卡莫
IEEE反式Nanotechnol10 (1PMID) 75 - 82 (2011):22611338助理

减少微流体通道的大小不仅为高精度生物大分子结晶的操作带来了新的机遇,但也使整个微流体系统的性能更容易受到不良运输生物分子之间的相互作用和通道的墙壁。在这个手稿,我们报告分子动力学模拟的驱使流经硅纳米通道的特点,与原子分辨率,其表面吸附模型的蛋白质。虽然模拟非特异性吸附的蛋白质被发现,它有一个戏剧性的影响蛋白质运输的速度。确定的相对强度protein-silica交互在不同吸附状态,我们模拟水解吸从硅表面的蛋白质。我们的分析蛋白质构象的吸附状态并未透露任何依赖简单的吸附强度的大小和构成protein-silica接触,这表明二氧化硅表面的异质性可能是一个重要的因素。