取向歧视的单链DNA在α-溶血素膜通道
我们描述voltage-driven运动和自由运动的单链DNA (ssDNA)分子捕获在大约1.5 nmα-溶血素毛孔,并表明DNA-channel交互强烈依赖的方向ssDNA分子对孔隙。值得注意的是,voltage-free扩散的3 '螺纹DNA(反式的cis方向)两次低于相应的5 '螺纹DNA拥有相同的聚(dA)序列。此外,离子电流流过阻塞毛孔与3的螺纹DNA或5 ' DNA相差约30%。所有原子分子动力学模拟系统揭示非对称行为的微观机理。封闭孔隙,ssDNA拉直及其基地偏向5 '端,假设一个不对称的构象。因此,基地的5 '螺纹DNA经历更大的有效摩擦和被迫重新定位,有利于co-passing离子。我们的研究结果暗示易位过程通过一个狭窄的孔隙比此前认为的更加复杂,涉及基础倾斜和拉伸ssDNA封闭孔隙内部的分子。