洞察旋转的分子机制ATP合酶的Fo部门

阿列克谢Aksimentiev, Ilya a . Balabin罗伯特·h·Fillingame,克劳斯·斯考尔滕提出
Biophys J86 (3)1332 - 44 (2004)
DOI:10.1016 / s0006 - 3495 (04) 74205 - 8PMID:14990464助理

(1)F (o) ATP合酶是一个无处不在的膜蛋白复合物,有效地将一个细胞的跨膜质子梯度转换成化学能存储为ATP。蛋白质是由两分子马达(o)和F(1),由一个中心耦合杆。膜单元,F (o),将跨膜电化学势转换为旋转机械转子的F (o)和身体连接中央柄。基于单个组件的可用数据,我们建立了一个所有原子模型的F (o)和研究通过分子动力学模拟和数学建模的机制扭矩代F (o)。出现的机制产生的扭矩在接口和c-subunits F (o)通过侧组激光器- 206,aarg - 210和aasn - 214的亚基和侧组c-subunits casp - 61。夫妻质子化作用机制/去质子化两个casp - 61组,并列的亚基在任何时候,个人c-subunit螺旋旋转以及整个c-subunit旋转。aarg - 210方集团主导的casp - 61组和,因此,建立了质子转移通过激光器- 206和质子half-channels aasn - 214,同时防止直接half-channels之间的质子转移。数学模型证明了可行性表示机制对负载转矩生成的典型在ATP合成;基本模型的特点,例如,螺旋和单元旋转摩擦常数有关,被带领测试并提供分子动力学模拟。