多分辨率模拟DNA纳米结构自组装

DNA折纸方法带来了nanometer-precision制造分子生物学实验室,提供无数的合成生物学领域的潜在应用,生物分子医学、分子计算等。推进方法进一步需要控制自组装到原子尺度。因此,快速、准确和详细的结构预测可以促进复杂的发展,功能性DNA折纸结构。朝着这个目标,我们开发了一个协议,将低分辨率的粗粒度模型的快速和健壮的结构弛豫的细节和原子的分子动力学模拟的准确性。在本教程中,我们将向您展示如何使用多分辨率的DNA (mrdna) Python包来执行这样的模拟。

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